Publication:
Các phân nhóm tiến hóa của các dòng SARS-CoV-2
Các phân nhóm tiến hóa của các dòng SARS-CoV-2
No Thumbnail Available
Files
Date
2022-07
Authors
Trương Thế Quang
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Research Projects
Organizational Units
Journal Issue
Abstract
Thu thập từ cơ sở dữ liệu GenBank (Hoa Kỳ) được 32 trình tự protein gai (S) của các biến thể SARS-CoV-2. Kết quả sắp hàng nhiều trình tự S các biến thể SARS-CoV-2 nhận diện được chín dòng SARS-CoV-2 là Gốc, Alpha, Beta, Gamma, Delta, Delta Plus, Iota, Kappa và Omicron. Các dòng có quan hệ tiến hóa gần với dòng Gốc là Iota (khoảng cách 0,00468), Delta (0,00545), Kappa (0,00546), Alpha (0,00548) và Beta (0,00665). Các dòng có quan hệ tiến hóa trung bình so với dòng Gốc là Delta Plus (0,00782) và Gamma (0,00938). Tất cả các dòng SARS-CoV-2 khác đều có quan hệ tiến hóa xa với dòng Omicron với khoảng cách từ 0,02473 đến 0,02837. Dựa vào các đột biến trên trình tự S và khoảng cách di truyền, dự đoán được hai phân nhóm tiến hóa từ dòng Gốc tạo thành các dòng SARS-CoV-2.
Description
Keywords
Các dòng SARS-CoV-2,
các phân nhóm tiến hóa,
protein gai,
sắp hàng nhiều trình tự