Publication:
Quan hệ tiến hóa của COVS dựa trên RBD
Quan hệ tiến hóa của COVS dựa trên RBD
No Thumbnail Available
Files
Date
2021-11
Authors
Trương Thế Quang
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Research Projects
Organizational Units
Journal Issue
Abstract
Thu thập 15 trình tự RBD của CoVs từ cơ sở dữ liệu GenBank (NCBI, USA). Sắp hàng nhiều trình tự CoVs RBD, xây dựng cây tiến hóa và nhận diện được ba phân chi CoVs là Sarbecovirus, Merbecovirus và Embercovirus. Phân chi Sarbecovirus có khoảng cách tiến hóa xa đối với Embercovirus 2,48226 và Merbecovirus 2,19391. Trong phân chi Sarbecovirus, human SARS-CoV2 và pangolin CoV có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với tỷ lệ tương đồng từ 94,10 đến 98,79%. Tiếp đến là human SARS-CoV2 và human SARS-CoV với tỷ lệ tương đồng 87,68%. Human SARS-CoV2 và bat SARS-CoV, human SARS-CoV2 và bat CoV đều có tỷ lệ tương đồng 85,14%. Điều này cho thấy, Sarbecovirus CoVs có khả năng tiến hóa thay đổi phạm vi vật chủ khác nhau như dơi, tê tê và người.
Description
Keywords
Phân chi Sarbecovirus,
protein gai (S),
sắp hàng nhiều trình tự RBD,
tỷ lệ tương đồng