Publication:
Quan hệ tiến hóa của các dòng phụ omicron
Quan hệ tiến hóa của các dòng phụ omicron
No Thumbnail Available
Files
Date
2022-09
Authors
Trương Thế Quang
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Research Projects
Organizational Units
Journal Issue
Abstract
Thu thập từ cơ sở dữ liệu GenBank, Hoa Kỳ được 21 trình tự protein gai S của các biến thể Omicron SARS-CoV-2 và một trình tự S tham chiếu (QIC53213) của biến thể Gốc. Kết quả sắp hàng nhiều trình tự S đã nhận diện được ba dòng phụ Omicron là BA.1 (B.1.1.529.1), BA.2 (B.1.1.529.2) và BA.3 (B.1.1.529.3). Cả ba dòng phụ BA.1, BA.2 và BA.3 đều có quan hệ tiến hóa xa với dòng Gốc với khoảng cách lần lượt là 0,02410, 0,02225 và 0,02559. Hai dòng phụ BA.1 và BA.3 có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với khoảng cách 0,00438. Đặc biệt, dòng phụ BA.2 có quan hệ tiến hóa xa với các dòng phụ BA.1 và BA.3 với khoảng cách tương ứng là 0,01285 và 0,01078.
Description
Keywords
Các dòng phụ Omicron,
protein gai,
quan hệ tiến hóa,
sắp hàng nhiều trình tự